RouterOS 的 VPN 系统支持多种方式的应用，能实现企业对等访问、企业与多分支点、多点与移动办公和 VPN数据转移等多种 VPN 连接方式。在 VPN 数据转移方面用处最多的方式是在 VoIP 方面，因为受某些 ISP 网络的限制，使得正常的 VoIP 通讯收到影响，所以可以通过 VPN 的方式实现数据的转移。
企业间对等互访
通过 VPN 隧道协议如 PPTP、 L2TP 或者 IPIP 可以建立一个对等的隧道，使得两个办公室能互相访问公司数据和文件。这种方式我们首先建立 PPP 服务器，并给客户端分配帐号和固定 IP 地址、建立 PPP 的拨号和分配 IP地址，最后设置两个远程局域网的 IP 地址路由
企业与分支点总分连接
我们可以使用 PPTP 或者 L2TP 等隧道协议，建立多个客户端账号，使多个分公司能链接到总公司的中心服务器，并能通过公司管理各个点的数据和信息互联。这样总公司做到对分公司的有效管理，可以即时发布信息到各个分公司。并能实现数据的安全传输。
企业移动办公与综合应用
RouterOS 支持普通用户的 PPTP 和 L2TP 的 windows 的拨号连接，所以对于在外出差和家庭办公的用户就可以方便的链接到总部的中心服务器和分支点的文件服务器，特别对需要即时处理问题的公司员工最为适合